Режим возможной работы с ИСС-ШИФР следующий: на некотором текстовом материале (близком к возможному словарю сообщений) автоматически формируется ИСС (10-20 мин.). Затем создаются ее копия(и) и передаются абонентам в виде дискет. Далее каждый зарегистрированный абонент вводит свое сообщение в ПЭВМ (1-2 тыс. знаков) где уже инсталлирована дискета с ИСС, в результате он получает код, который уже с начала может быть существенно короче исходного сообщения (при повторной передачи сообщения его код сокращается вообще до одного числа).

Система является очень (достаточно) простой функционально (10-20 мин занимает построение принципиально новой кодирующей структуры, смена же уже подготовленной составляет секунды), с достаточно быстрым процессом кодировки-декодировки сообщений - в реальном масштабе времени, следовательно может быть использована для проведения закрытого процесса телексных-телетайпных переговоров, а также, самое существенное, заключается в ее высокой криптографической надежности.